# treetime

> TreeTime 提供了祖先序列重建和分子钟系统发育推断的例程。
> 更多信息：<https://treetime.readthedocs.io/en/latest/tutorials.html>。

- 推断最大化联合或边际似然的祖先序列：

`treetime ancestral`

- 分析重复突变的模式，也称为同源性：

`treetime homoplasy`

- 估计分子钟参数并重新根植树形：

`treetime clock`

- 将离散特征（如宿主或国家）映射到树上：

`treetime mugration`