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# nextflow
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> 运行计算管道。主要用于生物信息学工作流。
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> 更多信息：<https://www.nextflow.io>。
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- 运行管道，使用之前运行的缓存结果：
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`nextflow run {{main.nf}} -resume`
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- 从 GitHub 运行远程工作流的特定版本：
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`nextflow run {{user/repo}} -revision {{release_tag}}`
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- 使用给定的工作目录保存中间文件，保存执行报告：
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`nextflow run {{workflow}} -work-dir {{path/to/directory}} -with-report {{report.html}}`
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- 显示当前目录中之前运行的详细信息：
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`nextflow log`
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- 删除特定运行的缓存和中间文件：
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`nextflow clean -force {{run_name}}`
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- 列出所有已下载的项目：
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`nextflow list`
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- 从 Bitbucket 拉取远程工作流的最新版本：
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`nextflow pull {{user/repo}} -hub bitbucket`
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- 更新 Nextflow：
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`nextflow self-update` |