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# treetime
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> TreeTime 提供了祖先序列重建和分子钟系统发育推断的例程。
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> 更多信息：<https://treetime.readthedocs.io/en/latest/tutorials.html>。
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- 推断最大化联合或边际似然的祖先序列：
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`treetime ancestral`
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- 分析重复突变的模式，也称为同源性：
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`treetime homoplasy`
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- 估计分子钟参数并重新根植树形：
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`treetime clock`
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- 将离散特征（如宿主或国家）映射到树上：
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`treetime mugration` |